Le 21ème siècle a vu une accélération des émergences d’agents pathogènes nouveaux et/ou exotiques tant chez l’humain que chez l’animal. Par ailleurs, 60% des maladies infectieuses sont communes à l’humain et l’animal et 75% des maladies infectieuses émergentes ont une origine animale. Fort de ce constat, nous nous attacherons à décrypter les facteurs de risques associés à ces émergences et la transgression de la barrière inter-espèces par les agents pathogènes notamment dans le domaine des infections respiratoires aigües, des maladies vectorielles et des pathogènes alimentaires.